جعل سماحة المرجع الديني الأعلى السيد محمد سعيد الحكيم (قدس سره) كفالة الأيتام والأرامل والمحتاجين في مقدمة اهتماماته. فمنذ تصدّيه لمقام المرجعية الدينية عام 1992، عمل سماحته على دعم هذا المشروع الإنساني.
ومع تصاعد أعداد الأيتام نتيجة الاستهداف المنهجي للأبرياء بعد عام 2003، وجّه سماحته بتأسيس مؤسسة تُعنى بكفالة الأيتام والأرامل وضحايا الإرهاب والعنف في عموم العراق. وقد تمثّل ذلك في تأسيس مؤسسة اليتيم الخيرية، التي افتُتحت في 4 نيسان 2007، لتتولى مسؤولية التخفيف من الأعباء الثقيلة التي خلّفها الإرهاب والعنف على كاهل الأيتام والأرامل.
يعنى القسم بتوفير الكفالات للأيتام من خلال لجان ميدانية متخصصة تعمل على الوصول إلى أهل الخير والعطاء لعرض برنامج الكفالة، وتوثيق بيانات الكافلين والأيتام المكفولين، وإعداد وصولات الكفالات.
يعمل قسم التبرعات والصناديق على نشر صناديق التبرعات في الأسواق التجارية والمحال والمؤسسات الأكاديمية عبر لجان التوزيع الميدانية. وبعد مرور ثلاثة أشهر، تقوم اللجان بجمع الأموال باستخدام الوسائل الإلكترونية الفورية وتسليم الوصولات مباشرة لأصحاب الصناديق، ثم تُسلَّم المبالغ إلى قسم الشؤون المالية.
يعنى القسم بإعداد التقارير المالية، وتحضير الموازنات، ووضع الخطط المتعلقة بالجوانب المالية، وصرف المستحقات والتخصيصات، وجرد وتقييم موجودات المؤسسة، إضافةً إلى الجرد السنوي. ومن أهدافه: ضبط الوضع المالي للمؤسسة، وتنظيم السيولة المالية (من خلال المصروفات والإيرادات)، وإعداد التقارير الدورية، فضلاً عن حفظ السندات والفواتير وتسجيلها وأرشفتها.
يعنى قسم الرعاية الاجتماعية بتوثيق بيانات الأسر من خلال لجان المسح الميداني المنتشرة في معظم المحافظات والأقضية والنواحي والقرى في العراق، حيث يتم جمع المعلومات ومعالجتها وتحليلها لاتخاذ القرار بشأن شمولها في برامج المؤسسة. ومن أبرز هذه البرامج: برنامج الراتب الشهري، السلة الغذائية، كسوة الأيتام، بناء وترميم المنازل، البرامج الصحية والتعليمية والترفيهية، إضافةً إلى تزويج الأيتام البالغين.
تعمل الإدارة على تحقيق الأهداف المحددة من خلال استثمار الموارد المتاحة وفق منهجية وبيئة عمل منظمة، وتشمل عدة شعب مثل: الوارد والصادر، الاستعلامات والخدمات، الآليات، تقنية المعلومات، والموارد البشرية.
يعنى القسم بتعزيز علاقة المؤسسة بالمجتمع، وإبراز دورها في تقديم الخدمات للأيتام، ومد جسور التعاون مع الجهات والهيئات والجمعيات والمؤسسات. كما يشمل نشاطه المشاركة في المؤتمرات والبرامج الإعلامية، ونشر أخبار المؤسسة عبر وسائل الإعلام ومواقع التواصل الاجتماعي، وإصدار المطبوعات والتقارير الإعلامية، وتوثيق الأنشطة وإنتاج المواد الفيلمية، واستثمار المناسبات في تنفيذ الحملات الإعلامية.